orca/multiwfn_installation_guide(20240926100545).md

2.1.2 Linux版本

注意：本节的中文版可在我的博客文章“Linux下安装Multiwfn的中文说明”中找到（http://sobereva.com/688）。

• 解压Multiwfn二进制包

• 确保已安装motif包，该包提供了libXm.so.4文件，完整版本的Multiwfn无法在没有该文件的情况下启动。Motif可在https://motif.ics.com/motif/downloads免费获取。如果你是CentOS或Red Hat Linux用户，且尚未安装motif，可以直接运行yum install motif命令来安装；或者你可以下载对应的rpm包（例如motif-2.3.4-1.x86_64.rpm）并手动安装。如果你是Ubuntu用户，运行以下命令安装：

  ```bash sudo apt-get install libxm4 libgl1 ```

  或者下载deb包（例如libmotif4_2.3.4-1_amd64.deb）并手动安装。

• 在~/.bashrc文件中添加以下行（可以使用例如vi ~/.bashrc命令）： ```bash export OMP_STACKSIZE=1000M ulimit -s unlimited ``` 这些行代码移除了栈内存的限制，并为每个OpenMP线程定义了1000MB的栈大小用于并行计算。详细信息见第2.4节。 注意：如果ulimit -s unlimited在你的系统上无法正常工作，请尝试使用ulimit -Sn unlimited代替。

• 运行： ```bash cat /proc/sys/kernel/shmmax ``` 检查SysV共享内存段的大小是否足够大（单位为字节）；如果值太小，Multiwfn在分析大波函数时可能会崩溃。要增大此值，例如，你可以在/etc/sysctl.conf中添加kernel.shmmax = 5000000000，然后重启系统，这样上限将增加到大约5GB。

• 假设你使用的是Bash Shell，并且已经将Multiwfn包解压到了/sob/Multiwfn_3.6_bin_Linux文件夹中，你应该将以下行添加到~/.bashrc文件中： ```bash export Multiwfnpath=/sob/Multiwfn_3.6_bin_Linux export PATH=$PATH:/sob/Multiwfn_3.6_bin_Linux ```

• 运行以下命令为Multiwfn可执行文件添加可执行权限： ```bash chmod +x /sob/Multiwfn_3.6_bin_Linux/Multiwfn ```

• 按照上一节中的说明配置Multiwfn文件夹中的settings.ini文件。

6 配置settings.ini 编辑Multiwfn目录下的settings.ini，搜索nthreads，将之数值改为计算时要用的并行核数，通常设为CPU的物理核心数即可。

settings.ini里还有几个其它设置想改的话可以根据需要修改一下 •formchkpath：定义的是Gaussian目录下的formchk程序的路径。formchk是干嘛的在《详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换》（http://sobereva.com/379）里明确说了。如果把它设成了formchk的实际的路径，Multiwfn就可以直接载入Gaussian的chk文件（在载入时会自动调用formchk转换成fch文件后载入）。 •orca_2mklpath：如果设成了ORCA目录下的orca_2mkl可执行文件的路径，Multiwfn就可以直接载入ORCA计算产生的gbw文件（在载入时会自动调用orca_2mkl转换成molden文件后载入）。 •gaupath和orcapath：当它们分别设成了Gaussian和ORCA的可执行文件的路径，Multiwfn的一些功能才能自动调用Gaussian和ORCA进行计算，如《使用Multiwfn超级方便地计算出概念密度泛函理论中定义的各种量》（http://sobereva.com/484）介绍的功能。

• 重新进入终端后，你可以通过简单地运行Multiwfn命令在任何地方启动Multiwfn。

• 如果你通过远程连接以文本模式使用Multiwfn，并且发现Multiwfn在加载输入文件后大约两秒钟内卡住，请将以下内容添加到~/.bashrc文件中： ```bash export DISPLAY=":0" ```

• Multiwfn的Linux版本在CentOS 6/7/8、Rocky Linux 9和Ubuntu 12/14/16/22上运行良好。我不能保证该程序完全兼容所有其他Linux发行版。如果系统提示你在启动Multiwfn时缺少某些动态链接库（.so文件），请尝试找到并安装包含相应.so文件的包。

• 如果由于缺少或不兼容某些与图形相关的库文件而在运行/编译Multiwfn时遇到困难，并且同时你不需要Multiwfn的任何可视化功能，你可以在不支持GUI的情况下运行/编译Multiwfn，所有与GUI和地图绘制无关的功能仍将正常工作。请查阅源码包中的“COMPLIATION_METHOD.txt”了解如何编译此特殊版本的详细信息，该版本的预编译可执行文件也可以从Multiwfn网站下载（称为“noGUI”版本）。

如果你是通过纯文本界面连接远程Linux服务器并在上面执行Multiwfn的普通版，并且发现启动Multiwfn时会短暂卡住，在~/.bashrc文件末尾加入export DISPLAY=":0"可以避免。