add .xvg 文件可视化
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@@ -265,6 +265,21 @@ EOF
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然后,就得到了相应的.gro、.top和.itp文件了,接下来可以进行gromacs的分子动力学运算了。
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## .xvg 文件可视化
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所有生成的 .xvg 文件可以使用 QtGrace(或其他工具)进行可视化。
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安装 QtGrace:
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bash
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复制代码
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sudo apt install qtgrace
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打开 .xvg 文件:
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bash
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复制代码
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qtgrace rmsd.xvg
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按照这些步骤,你可以逐步进行 RMSD、RMSF、氢键、以及回旋半径的分析。你可以根据需求修改命令中的选项以适应不同的分子或参数。
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## RNA 小分子模拟
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帖子:http://bbs.keinsci.com/thread-24273-1-1.html#:~:text=%E8%AF%B7%E6%95%99%E5%90%84%E4%BD%8D%E8%80%81%E5%B8%88%EF%BC%8C%E6%9C%AC
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