add .xvg 文件可视化

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2024-10-05 19:28:06 +08:00
parent 023d72a3f0
commit c921cffb25

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@@ -265,6 +265,21 @@ EOF
然后,就得到了相应的.gro、.top和.itp文件了接下来可以进行gromacs的分子动力学运算了。
## .xvg 文件可视化
所有生成的 .xvg 文件可以使用 QtGrace或其他工具进行可视化。
安装 QtGrace
bash
复制代码
sudo apt install qtgrace
打开 .xvg 文件:
bash
复制代码
qtgrace rmsd.xvg
按照这些步骤,你可以逐步进行 RMSD、RMSF、氢键、以及回旋半径的分析。你可以根据需求修改命令中的选项以适应不同的分子或参数。
## RNA 小分子模拟
帖子http://bbs.keinsci.com/thread-24273-1-1.html#:~:text=%E8%AF%B7%E6%95%99%E5%90%84%E4%BD%8D%E8%80%81%E5%B8%88%EF%BC%8C%E6%9C%AC