From c921cffb255d59a9eafcbb13a89211905a88e50d Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: root Date: Sat, 5 Oct 2024 19:28:06 +0800 Subject: [PATCH] =?UTF-8?q?add=20.xvg=20=E6=96=87=E4=BB=B6=E5=8F=AF?= =?UTF-8?q?=E8=A7=86=E5=8C=96?= MIME-Version: 1.0 Content-Type: text/plain; charset=UTF-8 Content-Transfer-Encoding: 8bit --- README.md | 15 +++++++++++++++ 1 file changed, 15 insertions(+) diff --git a/README.md b/README.md index 6488d99..e914ad7 100755 --- a/README.md +++ b/README.md @@ -265,6 +265,21 @@ EOF 然后,就得到了相应的.gro、.top和.itp文件了,接下来可以进行gromacs的分子动力学运算了。 + +## .xvg 文件可视化 + +所有生成的 .xvg 文件可以使用 QtGrace(或其他工具)进行可视化。 + +安装 QtGrace: +bash +复制代码 +sudo apt install qtgrace +打开 .xvg 文件: +bash +复制代码 +qtgrace rmsd.xvg +按照这些步骤,你可以逐步进行 RMSD、RMSF、氢键、以及回旋半径的分析。你可以根据需求修改命令中的选项以适应不同的分子或参数。 + ## RNA 小分子模拟 帖子:http://bbs.keinsci.com/thread-24273-1-1.html#:~:text=%E8%AF%B7%E6%95%99%E5%90%84%E4%BD%8D%E8%80%81%E5%B8%88%EF%BC%8C%E6%9C%AC