add RNA 小分子模拟

README.md

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-然后，就得到了相应的.gro、.top和.itp文件了，接下来可以进行gromacs的分子动力学运算了。
+然后，就得到了相应的.gro、.top和.itp文件了，接下来可以进行gromacs的分子动力学运算了。
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+## RNA 小分子模拟
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+帖子：http://bbs.keinsci.com/thread-24273-1-1.html#:~:text=%E8%AF%B7%E6%95%99%E5%90%84%E4%BD%8D%E8%80%81%E5%B8%88%EF%BC%8C%E6%9C%AC
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+RNA可以用Amber的Parmbsc1的力场，是amber中最新的适合模拟核酸的力场，文献见（Orozco et al. Nature methods, 13(1), pp.55-58.）不过OL5和OL3也可以用于核酸模拟，据说也能准确描述，不过我模拟核酸都用bsc1。
+单纯的常规MD就用水中溶菌酶那个教程就行。力场用我上面提到的就行。
+不过你模拟两个碱基的RNA有什么意义吗？是要模拟碱基配对过程（比如不同碱基之间的配对，这个貌似有人研究过了）吗还是怎么样。
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+你可以看下这篇文章，今晚才看见的，
+Assessment of AMBER Force Fields for Simulations of ssDNA（DOI: 10.1021/acs.jctc.0c0093）