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README.md

@@ -10,6 +10,7 @@ conda create -n pyfastx modeller biopython pymol-open-source biopandas requests
 # modeller注册码：MODELIRANJE (<conda_env>//lib/modeller-10.4/modlib/modeller/config.py)
 # 绘图环境 统计test.py
 conda install -c conda-forge seaborn -y
+pip install python-calamine
 ```
 
 modeller注册码：`MODELIRANJE`
@@ -151,7 +152,29 @@ ___
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 下面是多聚体修复记录:
 
+1mwa: D 链 116 117 动画缺失，实际不缺失
 
+3mbe: F链loop区域太多， 多聚体另外一部分结构缺失
+
+3pqy: 根据fasta序列信息选择：chain B or chain K or chain M or chain O or chain E。TCR蛋白两条链中间有插入一个Beta-2-microglobulin导致TCR两条链分开。
+Beta-2-microglobulin (β2微球蛋白) 是一种小型蛋白质，广泛存在于所有核细胞的表面。它是主要组织相容性复合体 (MHC) 类I分子的轻链部分，与MHC类I的重链结合，不仅参与细胞间的免疫识别，还在多种生理和病理过程中发挥作用。
+
+`3sjv` 多聚体loop区域太多 剔除
+
+`4e41` HMC区域缺失  剔除
+
+`4h1l` loop区域太多 剔除
+
+`4p2q` `4p2r`  peptide 0位缺失，并且没有在HMC上面呈递
+
+`4z7u` 修复之后阿尔法螺旋和β折叠 变成了loop区域
+
+# `4p2q` `4p2r` `4z7u` 这些多聚体修复之后出现了 阿尔法螺旋和β折叠 变成了loop区域， 尝试提取单聚体在修复
 
 ``
 
+cmd.select('sele', '4mji and (chain D or chain E or chain C or chain A or chain B)')
+
+cmd.save('C:/Users/lingyuzeng/Documents/newfix0123/multimer_polymeric_extra/3ffc.pdb', 'sele')
+
+# 先提取单体之后尝试修复