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README.md

@@ -6,13 +6,13 @@
 
 ```shell
 micromamba create -n modeller modeller biopython pymol-open-source biopandas requests ipython ipykernel pydantic pyfastx ipython -y -c conda-forge -c salilab -c bioconda
-conda create -n pyfastx modeller biopython pymol-open-source biopandas requests ipython ipykernel pydantic pyfastx ipython -y -c conda-forge -c salilab -c bioconda
+conda create -n pyfastx modeller biopython pymol-open-source biopandas requests ipython ipykernel pydantic pyfastx ipython seaborn -y -c conda-forge -c salilab -c bioconda
 # modeller注册码：MODELIRANJE (<conda_env>//lib/modeller-10.4/modlib/modeller/config.py)
 # 绘图环境 统计test.py
 conda install -c conda-forge seaborn -y
 ```
 
-modeller注册码：`MODELIRANJE``
+modeller注册码：`MODELIRANJE`
 
 ## test 
 
@@ -85,7 +85,7 @@ peptide P
 ----
 单聚体记录：
 
-`1ao7` E 链 225 THR 是缺失 PDB文件结构也正常 可能是坐标脱离太原导致缺失
+`1ao7` E 链 221-225 THR 是缺失 PDB文件结构也正常 可能是坐标脱离太原导致缺失。 经过观察，221和222为的TRP和GLU 肽键的C-N长度为2.0 埃（Å），碳（C）和氮（N）原子之间的典型距离大约是 1.32 埃（Å）。导致动画结构展示不正确，需要手动删除然后，建模修复。
 
 `3qiu` `4ozf` 拖尾
 
@@ -105,7 +105,11 @@ peptide P
 
 `7jwj` A链拖尾太长
 
+`5ksa` peptide （J 链）-1 到1发现缺失（0位缺失），但是实际上需不需要修复的，但是进行了修复，所以这里是peptide编号错误。
 
+`6bga` 138-139 位置不合理缺失，需要手动删除序列位置然后修复
+
+`7rdv` C链拖尾太长，修复失败，需要后续检查原因
 
 tcr: DE
 mhc I