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2024-01-26 15:41:50 +08:00
parent b40325dd20
commit 0612fa3e41
1 changed files with 20 additions and 0 deletions
--- a/README.md
+++ b/README.md
@@ -128,6 +128,26 @@ peptide Q

 `7rk7` 在A链末端出现大面积结构缺失，使用modeller修复了这些区域导致出现大面积的loop区域，考虑使用，使用ESMfold 修复D链。

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+总结：2024-01-26
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+7rk7缺失的很厉害，3mv7，8，9这三个modeller修复不了，我用ESMfold修复的。这四个另作考虑。
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+单体，6个MD差集的问题
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+7rdv B链尾部loop过多，用ESMfold预测可能更好
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+6bj2 结构A链建模修复后不见了？有问题待修复。同时chain D上面的β折叠在修复后不见了，尝试重新修复，检查问题。重新修复后结构展示正常。
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+1nam L链尾部loop过多，用ESMfold预测可能更好
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+3o4l，5ksa，结构完好
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+6bga，结构整体没有问题，但是，peptide不在HMC的抓手的两个α螺旋中，非典型的TCR-pHMC的结构特征。modeller修复正常
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 下面是多聚体修复记录: