From 0612fa3e4116e9f01bcf32256a0d8b0de5d997b8 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: lingyuzeng Date: Fri, 26 Jan 2024 15:41:50 +0800 Subject: [PATCH] update record --- README.md | 20 ++++++++++++++++++++ 1 file changed, 20 insertions(+) diff --git a/README.md b/README.md index a15e86f..a9930cc 100755 --- a/README.md +++ b/README.md @@ -128,6 +128,26 @@ peptide Q `7rk7` 在A链末端出现大面积结构缺失，使用modeller修复了这些区域导致出现大面积的loop区域，考虑使用，使用ESMfold 修复D链。 +___ +总结：2024-01-26 + + +7rk7缺失的很厉害，3mv7，8，9这三个modeller修复不了，我用ESMfold修复的。这四个另作考虑。 + +—————— + +单体，6个MD差集的问题 + +7rdv B链尾部loop过多，用ESMfold预测可能更好 + +6bj2 结构A链建模修复后不见了？有问题待修复。同时chain D上面的β折叠在修复后不见了，尝试重新修复，检查问题。重新修复后结构展示正常。 + +1nam L链尾部loop过多，用ESMfold预测可能更好 + +3o4l，5ksa，结构完好 + +6bga，结构整体没有问题，但是，peptide不在HMC的抓手的两个α螺旋中，非典型的TCR-pHMC的结构特征。modeller修复正常 + ------- 下面是多聚体修复记录: