gromacs_docker

在容器中使用gpu需要安装：nvidia-container-toolkit

运行命令：

docker run -it --net=host --gpus all --name 容器名 -e NVIDIA_DRIVER_CAPABILITIES=compute,utility -e NVIDIA_VISIBLE_DEVICES=all 镜像名

首次使用报错：

docker: Error response from daemon: could not select device driver “” with capabilities: [[gpu]].

解决办法：

sudo curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-container-runtime/gpgkey | \
  sudo apt-key add -
distribution=$(. /etc/os-release;echo $ID$VERSION_ID)
sudo curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-container-runtime/$distribution/nvidia-container-runtime.list | \
  sudo tee /etc/apt/sources.list.d/nvidia-container-runtime.list
sudo apt-get update

sudo apt-get install nvidia-container-runtime

02 验证执行下列命令：

which nvidia-container-runtime

输出 /usr/bin/nvidia-container-runtime，表示安装成功。 03 docker 使用:

docker run -it --gpus all **

此时，设置使用设备上全部的显卡。

目前尚不支持debian12

Dockerfile.lower

为一些老旧的cpu一些加速指令集用

Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2650 v2 @ 2.60GHz