add uv use examples

.gitignore

@@ -4,4 +4,5 @@ __pycache__/
 *.pyc# pixi environments
 .pixi/*
 !.pixi/config.toml
-*.egg-info/
+*.egg-info/
+*.zip

README.md

@@ -382,4 +382,36 @@ uv run embedding-atlas data/drugbank_split_merge.csv --text smiles
 
 如需调整默认镜像或端口，可在 `docker/docker-compose.yml` 中覆盖 `EMBEDDING_*` 环境变量，或在部署时通过 `.env` 文件注入。
 
-> 注意：由于 orchestrator 运行在容器内并通过 DinD 调度新容器，如需在宿主机直接访问 `embedding-atlas` 的 Web UI，需要确保相应端口从 `docker_engine_1` 转发到宿主，可按需求使用 `podman port` 或额外的反向代理。
+> 注意：由于 orchestrator 运行在容器内并通过 DinD 调度新容器，如需在宿主机直接访问 `embedding-atlas` 的 Web UI，需要确保相应端口从 `docker_engine_1` 转发到宿主，可按需求使用 `podman port` 或额外的反向代理。
+
+## 使用 uv 同步依赖并导出 ring12–20 ginhib≥30 的可视化应用
+
+- **同步依赖**
+```bash
+uv sync
+```
+
+- **导出独立网页 ZIP**（基于已合并的数据 `data/ring12-20_fragments_filtered_predicted_ginhib_ge30_merged.csv`）
+```bash
+uv run embedding-atlas data/ring12-20_fragments_filtered_predicted_ginhib_ge30_merged.csv \
+  --text cleaned_smiles \
+  --model all-MiniLM-L6-v2 \
+  --export-application data/ring12-20_ginhib_ge30_visualization.zip
+```
+
+- **解压并本地预览 index.html**
+```bash
+unzip -o data/ring12-20_ginhib_ge30_visualization.zip -d data/ring12-20_ginhib_ge30_visualization
+```
+
+预览方式：
+- **VS Code Live Server 插件**：在解压目录中右键 `index.html` → “Open with Live Server”
+- **内置 HTTP 服务**（可选）：
+```bash
+python -m http.server 8000 --directory data/ring12-20_ginhib_ge30_visualization
+# 浏览器打开 http://localhost:8000/index.html
+```
+
+网络提示：首次运行若需下载模型，可设置镜像以提升稳定性：
+```bash
+export HF_ENDPOINT=https://hf-mirror.com