# Git 相关
.git
.gitignore
.gitattributes

# Docker 相关
docker/
.dockerignore

# Python 相关
__pycache__/
*.py[cod]
*$py.class
*.so
.Python
env/
venv/
ENV/
env.bak/
venv.bak/

# 数据文件
data/
results/
output/
*.pdb
*.sdf
*.mol2
*.xyz

# 日志文件
*.log
logs/

# 临时文件
*.tmp
*.temp
.DS_Store
Thumbs.db

# IDE 相关
.vscode/
.idea/
*.swp
*.swo

# 系统文件
.DS_Store
Thumbs.db

# 文档
*.md
docs/

# 测试文件
test/
tests/
*_test.py
test_*.py