39 lines
1.1 KiB
Docker
39 lines
1.1 KiB
Docker
FROM nvidia/cuda:12.4.1-cudnn-devel-ubuntu22.04
|
|
# 将 <CUDA_VERSION> 替换为您的目标 CUDA 版本
|
|
# 将 <OS_VERSION> 替换为您的目标操作系统版本，例如 ubuntu20.04
|
|
|
|
# 安装必要的编译器和库
|
|
RUN apt-get update && apt-get install -y \
|
|
build-essential \
|
|
cmake \
|
|
git \
|
|
bzip2-devel cmake3 gcc-gfortran g++ lzip tcl-devel zlib libzip-devel
|
|
|
|
# 设置工作目录
|
|
WORKDIR /amber
|
|
|
|
# 复制 Amber 源代码到容器中
|
|
COPY AmberTools24.tar.bz2 /amber/
|
|
COPY Amber24.tar.bz2 /amber/ # 如果您已获得 Amber24 许可证
|
|
|
|
# 解压 Amber 源代码
|
|
RUN tar xvfj AmberTools24.tar.bz2 && \
|
|
tar xvfj Amber24.tar.bz2 # 如果您已获得 Amber24 许可证
|
|
|
|
# 进入 AmberTools24 源代码目录
|
|
WORKDIR /amber/amber24_src/build
|
|
|
|
# 使用 cmake 配置 Amber 构建选项
|
|
RUN ./run_cmake -DMPI=TRUE -DCUDA=TRUE \
|
|
-DCUDA_ARCH=native,sm_86,sm_75,sm_87
|
|
# ... 其他 cmake 选项
|
|
|
|
# 构建 Amber
|
|
RUN make install
|
|
|
|
# 设置 Amber 环境变量
|
|
ENV AMBERHOME /amber/amber24
|
|
ENV PATH $AMBERHOME/bin:$PATH
|
|
|
|
# 测试 Amber 安装 (可选)
|
|
RUN cd $AMBERHOME && make test.parallel |