- Add base_prokka genome annotation tool with pixi config - Add CRISPR-Cas analysis src (CRISPRCasFinder.pl, environment config) - Add test data and documentation Co-Authored-By: Claude <noreply@anthropic.com>
prokka 这个环境,是进行基因组注释的,这是进行原核生物分析的第一步,运行这个后,会得到相应的基因注释文件; 后续的crispr鉴定,需要输入的文件有gff、faa文件,这些文件是从prokka的运行得到的; 后面bgc的鉴定,也需要prokka的结果文件。