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bttoxin-pipeline/tools/base_prokka
zly 8e0deb1691 feat: add base_prokka tool and CRISPR-Cas analysis source code
- Add base_prokka genome annotation tool with pixi config
- Add CRISPR-Cas analysis src (CRISPRCasFinder.pl, environment config)
- Add test data and documentation

Co-Authored-By: Claude <noreply@anthropic.com>
2026-01-28 20:31:00 +08:00
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prokka 这个环境,是进行基因组注释的,这是进行原核生物分析的第一步,运行这个后,会得到相应的基因注释文件; 后续的crispr鉴定需要输入的文件有gff、faa文件这些文件是从prokka的运行得到的 后面bgc的鉴定也需要prokka的结果文件。