# BtToxin Digger v5 容器镜像
# 基于 pixi 管理的 conda 环境

FROM ghcr.io/prefix-dev/pixi:latest

WORKDIR /app

# 复制 pixi 配置
COPY pixi.toml .
COPY pixi.lock .

# 安装依赖
RUN pixi install

# 复制外部数据库替换默认数据库
# 注意：必须在 pixi install 之后执行，且需要先清理原有目录以确保完全替换
# 这一步假设构建上下文包含 external_dbs 目录
RUN rm -rf /app/.pixi/envs/default/bin/BTTCMP_db/bt_toxin
COPY external_dbs/bt_toxin /app/.pixi/envs/default/bin/BTTCMP_db/bt_toxin

# 创建工作目录
RUN mkdir -p /app/jobs /app/data

# 暴露常用端口
EXPOSE 9000

# 默认命令
CMD ["pixi", "run", "BtToxin_Digger", "--help"]