From 72bc06f703063c1a40ebab23879675ae06f4311b Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: mm644706215 Date: Thu, 28 Aug 2025 22:17:33 +0800 Subject: [PATCH] add ADMET screening description --- README.md | 32 ++++++++++++++++++++++++++++++++ 1 file changed, 32 insertions(+) diff --git a/README.md b/README.md index 2345216..91f28a6 100644 --- a/README.md +++ b/README.md @@ -25,3 +25,35 @@ python -c "import torch,sys;print(torch.__version__)" pip install --upgrade 'torch<2.6' pip install --upgrade 'torch<2.6' --index-url https://download.pytorch.org/whl/cu121 ``` + + +## 筛选关注的关键属性说明 + +在抗菌药物候选分子的 ADMET 评估中,本研究主要关注以下 8 个属性,并设置经验阈值作为参考。阈值的设定用于初步风险控制和优先级排序,并非绝对淘汰标准。 + +### 毒理学属性(应尽量低于阈值) + +- **AMES (< 0.5)** + - Ames 致突变实验预测结果。高值表示有潜在的基因突变风险。 +- **Carcinogens_Lagunin (< 0.5)** + - 致癌性预测。高值表示分子可能存在致癌风险。 +- **ClinTox (< 0.5)** + - 临床毒性模型预测。高值代表在临床阶段出现毒副作用的可能性较大。 +- **DILI (< 0.5)** + - 药物性肝损伤(Drug-Induced Liver Injury)。高值表示存在较强肝毒性风险。 +- **hERG (< 0.5)** + - 针对心脏钾通道 hERG 的抑制概率。高值代表心脏毒性风险增加。 + +### 吸收与利用度属性(应尽量高于阈值) + +- **Bioavailability_Ma (> 0.5)** + - 口服生物利用度预测。高值表示药物在体内更容易被吸收并进入循环。 +- **HIA_Hou (> 0.5)** + - 人体肠道吸收(Human Intestinal Absorption)。高值代表口服吸收效果更好。 +- **Caco2_Wang (> 0.5)** + - 基于 Caco-2 细胞模型的渗透性预测。高值说明分子透膜能力较好。 + +### 总结 +- **毒理学属性** 是硬约束(应尽量低于阈值,减少毒副作用风险)。 +- **吸收与利用度属性** 是优选指标(应尽量高于阈值,保证体内可达有效浓度)。 +- 阈值 **0.5** 为经验值,后续可结合分布曲线调整,更贴近抗菌药物实际特性。