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a8fea027ac
feat: 实现大规模并行预测功能 (v2.0.0)
master
hotwa
2025-10-18 20:53:39 +08:00
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4745ce3884
抗菌预测模型输出格式字段解释
hotwa
2025-10-17 21:27:12 +08:00
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576881116a
add macos support
hotwa
2025-10-17 20:35:25 +08:00
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34102cf459
1. 代码修改 models/broad_spectrum_predictor.py: ✅ 新增 StrainPrediction dataclass(单个菌株预测结果) ✅ 更新 BroadSpectrumResult 添加 strain_predictions 字段(pandas.DataFrame 类型) ✅ 添加 to_strain_predictions_list() 方法(类型安全转换) ✅ 新增 _prepare_strain_level_predictions() 方法 ✅ 修改 predict_batch() 方法支持 include_strain_predictions 参数 utils/mole_predictor.py: ✅ 添加 include_strain_predictions 参数到所有函数 ✅ 添加命令行参数 --include-strain-predictions ✅ 实现菌株级别数据与聚合结果的合并逻辑 ✅ 更新所有函数签名和文档字符串 2. 测试验证 ✅ 测试基本功能(仅聚合结果): test_3.csv → 3 行输出 ✅ 测试菌株级别预测功能: test_3.csv → 120 行输出(3 × 40) ✅ 验证输出格式正确性 ✅ 验证每个分子都有完整的 40 个菌株预测 ✅ 验证革兰染色信息正确(18 个阴性菌 + 22 个阳性菌) 3. 文档更新 README.md: ✅ 更新命令行使用示例 ✅ 添加 Python API 使用示例(包含菌株预测) ✅ 添加详细的输出格式说明 ✅ 添加 40 种菌株列表概览 ✅ 添加数据使用场景示例(强化学习、筛选、可视化) Data/mole/README.md: ✅ 新增"菌株级别预测详情"章节 ✅ 完整的 40 种菌株列表(分革兰阴性/阳性) ✅ 数据访问方式示例(CSV 读取、Python API) ✅ 强化学习应用场景(状态表示、奖励函数设计) ✅ 数据可视化代码示例 ✅ 性能和存储建议
hotwa
2025-10-17 16:46:04 +08:00
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62e0f3d6aa
一般情况更新,文件注释等
hotwa
2025-10-17 16:08:44 +08:00
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f30f9ccd3d
mole env
hotwa
2025-10-17 16:08:14 +08:00
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e51f49e87a
add
hotwa
2025-10-17 15:54:13 +08:00
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336bfe4b65
add mole predcit module
hotwa
2025-10-17 15:54:00 +08:00
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ea218a3a39
update
mm644706215
2025-10-16 17:26:35 +08:00
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b1d437a06d
25w分子化学空间可视化
mm644706215
2025-03-20 15:20:57 +08:00
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2b14fef784
案例分析,100w大环内酯结构的分析与同步命令
mm644706215
2025-03-19 22:22:59 +08:00
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2cf856c51b
14元环的大环内酯的化学结构图片位置
mm644706215
2025-03-19 22:04:57 +08:00
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d104083ea3
可视化工具操作
mm644706215
2025-03-19 22:02:18 +08:00
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8960d56f61
抽象出来smiles的母核结构
mm644706215
2025-03-19 22:02:03 +08:00
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d5f510ce2c
add commnet
mm644706215
2025-02-26 12:56:45 +08:00
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45766db7dd
update
mm644706215
2025-02-18 21:25:36 +08:00
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d139286d61
change numpy version
mm644706215
2025-02-18 21:25:03 +08:00
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fc359427b4
add apptainer def
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2024-12-27 15:47:00 +08:00
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1b87eab156
add config
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2024-12-24 10:25:04 +08:00
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736373c280
change output fold
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2024-12-23 22:39:22 +08:00
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9ee4b90bbb
create fold before read
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2024-12-23 22:38:57 +08:00
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4a270fa72d
listen in 0.0.0.0
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add docker
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2024-12-23 22:03:43 +08:00
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6e2d2a4715
link to V1B full database -- file format adjusted
pkyawzi
2020-01-30 11:19:25 -05:00
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link to V1B full database added.
pkyawzi
2020-01-30 11:18:27 -05:00
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link to V1B full database added.
pkyawzi
2020-01-30 11:12:49 -05:00
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README.md file updated.
zinph
2020-01-26 22:59:57 -05:00
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README.md file updated.
zinph
2020-01-26 19:18:15 -05:00
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e99c4150fa
added button to go back to main page. default files work.
zinph
2020-01-26 19:09:52 -05:00
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attached the webapplication GUI
zinph
2020-01-26 18:42:57 -05:00
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name changed and data folder added
zinph
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first commit
zinph
2020-01-21 21:34:26 -05:00